Исходная точка Маркиона — это теодицея. Основной вопрос, который он задаёт: «откуда приходит зло?» — unde malum? Он находит ответ в Лк. 6:43, притче о двух деревьях: нет доброго дерева, которое приносит дурной плод, и нет дурного дерева, которое приносит добрый плод. Добро и зло не могут иметь общее происхождение.
В Ис. 45:7 Бог утверждает себя творцом света и тьмы, добра и зла. Такой бог, думает Маркион, может быть лишь дурным деревом.Он известен нам из Би­ блии только как справедливый, но не благой. Благой Бог неведом и naturalier ignotus, непознаваем естественными средствами.